北京
包括基因編輯、免疫療法和 RNA 藥物在內(nèi)的突破性療法，都需要快速、大規(guī)模的基因組分析。整合海量基因組數(shù)據(jù)和單細(xì)胞數(shù)據(jù)對(duì)于靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)更安全的干預(yù)措施至關(guān)重要，而傳統(tǒng)流程往往會(huì)將研究周期拉長(zhǎng)至數(shù)月甚至數(shù)年。
NVIDIA BioNeMo 平臺(tái)由 GPU 加速的工具、框架和 AI 模型組成，其中包括 NVIDIA Parabricks 和 NVIDIA CUDA-X Data Science（DS）庫(kù)，可大幅加速基因組學(xué)工作流。
在 GTC 大會(huì)上，NVIDIA 重點(diǎn)介紹了一批新興醫(yī)療與生命科學(xué)企業(yè)，它們正在借助 BioNeMo 進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和模型開發(fā)，以解鎖全新的療法突破。
解碼神經(jīng)回路：全腦尺度可視化基因組級(jí) CRISPR 擾動(dòng)；圖片由 PerturbAI 提供
- Basecamp Research 聯(lián)合 Ultima Genomics 和 PacBio 等，并依托 NVIDIA AI 基礎(chǔ)設(shè)施，推出 Trillion Gene Atlas（TGA）——這是一項(xiàng)旨在將人類對(duì)基因多樣性的認(rèn)知提升百倍的生物數(shù)據(jù)采集計(jì)劃。
- Tahoe Therapeutics 構(gòu)建了全球最大的單體單細(xì)胞數(shù)據(jù)集 Tahoe-100M，用于打造新的虛擬細(xì)胞模型架構(gòu)。Tahoe-100M 的訓(xùn)練流程完全運(yùn)行在 NVIDIA Hopper GPU 上，并使用 NVIDIA cuVS 庫(kù)。Tahoe 計(jì)劃通過(guò)在 NVIDIA DGX 系統(tǒng)上運(yùn)行并結(jié)合由 scverse 開發(fā)的 RAPIDS-singlecell 框架，將規(guī)模擴(kuò)展至 10 億細(xì)胞級(jí)別。
- PerturbAI 與 NVIDIA 生物基礎(chǔ)模型研究團(tuán)隊(duì)合作，發(fā)布了全球規(guī)模最大的體內(nèi) CRISPR 功能基因組圖譜——包含近 800 萬(wàn)個(gè)全腦細(xì)胞的數(shù)據(jù)集，構(gòu)建了目前在活體組織中規(guī)模最大的基因功能因果關(guān)系圖譜之一。該公司正在使用 NVIDIA CUDA-X DS 深入探索神經(jīng)退行性疾病、精神疾病和代謝疾病背后的全新生物機(jī)制。
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