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導語
免疫現象是思考生命復雜性的理想場景。免疫系統能在數十億種可能的病原體中識別威脅并將之消除,也能在機體遭遇損傷時協調資源啟動修復。
如何在AI驅動的復雜科學世紀,迭代我們對免疫現象的認知?這是我們組織這場讀書會的初衷。
本次讀書會由秦健勇、敖平、雷錦志、張曉實及秦曉玉共同發起,試圖基于新生物學2009白皮書從多個維度——物理、數學、AI、臨床——實現對免疫現象的迭代理解。
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免疫現象是思考生命復雜性的理想場景。免疫系統能在數十億種可能的病原體中識別威脅并將之消除,也能在機體遭遇損傷時協調資源啟動修復。
——然而,我們當前仍對這種每時每刻發生在我們體內數以萬億級各類細胞間的交互作用全景,仍知之不多。
現有的觀察、證據和理論已經將免疫視作一個動態網絡系統,其中有數不清的節點和交互作用模塊。
免疫網絡理論,最早由 Niels Jerne在1974年正式發表文章提出,當時成為學術界關注的熱點。其后經歷了分子生物學的崛起,免疫研究開始進入高分辨率解讀的時代。免疫機制的解讀歷來是諾貝爾獎的聚焦點,革命性的免疫檢查點抑制劑最終打破了腫瘤免疫治療的尷尬局面,2025年諾獎再次花落免疫:Treg研究獲得諾獎。而Treg正是免疫網絡中陰陽對稱性結構中極為重要的一環。
如果將免疫現象視作網絡結構,目前仍面臨微觀機制解析和分辨率不足的困境,且由于大量多hierarchy數據的積累,亟需理論指導與算力加持配合以獲得清晰的免疫調控機制框架。
目前理論生物學和生物學研究機制之間仍存在著巨大的裂隙,亟需彌合。
復雜科學興起于20世紀80年代,其建立者代表了人類頂尖的智力水準,其初衷似乎是在響應Max Karl Ernst Ludwig Planck在世紀之初關于學科壁壘的思考。
位于美國西部的那座山巔神殿SFI是復雜科學研究的圣地,一代宗師Philip Anderson參與了早期奠基。Anderson堅信21世紀是復雜科學的世紀,其曾特意詢問好友楊振寧的觀點,楊老默而不語。SFI成立40余年來,致力于尋求理解復雜現象的通用理論框架,雖理論探索頗有成果,對諸多學科也頗有影響,但在轉化實踐上舉步維艱,亟需突破。
2025年,現任SFI所長David Krakauer薈萃群英,將之前系統回顧提煉出的對構建復雜科學理論最為關鍵89篇經典文獻編撰成冊,試圖從經典中尋求靈感。
已有的復雜科學體系已經在生命現象的基本理論框架上有了頗具啟發的建構。SFI所長David Krakauer在《Multiple Paths to Multiple Life》中建構的一個三明治式理論模型,就試圖基于第一性原理剖析生命現象的底層運行機制,對理解復雜生命現象背后的簡單性原理極有啟發。
中國學者敖平是理論物理學博士出身,師從多位一流學者;早在1999年,已是瑞典某大學理論物理副教授的他,最終決定追隨系統生物學的奠基人之一Leroy Hood進入生命科學領域。隨后,敖平加入Hood新成立的系統生物研究院(Institute for Systems Biology,簡稱ISB),成為一名系統生物學家。
2005年,敖平教授基于第一性原理視角構建了達爾文演化力學,試圖為生命現象提供一個第一性原理框架。20余年來,敖教授致力于使用以演化力學為基座的內源性網絡這一方法論去剖析復雜生命現象的底層運行機制。敖平教授苦心孤詣的努力,似乎是在接力著Niels Jerne提出免疫網絡理論后另一位學者Alan Perelson對免疫網絡的首次數學建構(1989年)。敖平演化力學方程極為簡潔優美,dq/dt=-[D(q)-J(q)]▽H(q)+ξ(q,t),企圖為復雜現象的演化過程構建一個統一的動力學方程。
從原核生物的CRISPR,這種最基礎的適應性免疫形式,到脊椎動物以免疫球蛋白家族為基本元素的復雜適應性免疫,演化已經跨越了數十億年。數百種細胞亞群、數以萬計的信號分子與代謝物,再加上微生物群落與宿主之間的實時博弈,構成了一個以獵手和獵物為主角的復雜網絡圖景。而免疫失調,直接對應著癌癥、自身免疫疾病、COVID-19感染后長新冠的免疫紊亂綜合征等臨床現實。免疫紊亂,從普通的過敏到致命的癌癥,是一個常見的健康問題。
理解免疫現象,現有的研究提供了大量素材,但非常碎片化;只有將它們放置在生命理論框架的背景中,才可能洞察那些數據的物理意義。例如,理解和調控T淋巴細胞的功能和行為,需要結合腫瘤微環境的代謝狀態、腸道菌群的構成、宿主的心理壓力水平,乃至晝夜節律等。
如何在AI驅動的復雜科學世紀,迭代我們對免疫現象的認知?這是我們組織這場讀書會的初衷。
本次讀書會由秦健勇、敖平、雷錦志、張曉實及秦曉玉共同發起,試圖基于新生物學2009白皮書從多個維度——物理、數學、AI、臨床——實現對免疫現象的迭代理解。
背景:
正在發生的科學范式轉型
2009年,美國國家科學院發布了一份白皮書,名為《新生物學:確保美國引領即將到來的生物學革命》(A New Biology for the 21st Century)。白皮書的核心判斷是:生物學正站在一場革命的入口。
——這場革命,可不僅僅是技術的躍進,也包含了科學研究范式的轉型。
報告指出,新生物學的實踐在于整合物理科學、數學、計算科學與工程學的理論與方法,能對生命系統的復雜性做出前所未有的解讀。新生物學家,不僅要會做傳統“濕實驗”,也需具有較高的理論水平,成為能在物理、數學、計算與生物之間自由穿行的跨學科建構者。
15年后的2024年,一篇發表于 PNAS Nexus 的論文對科學史上761項重大發現進行了系統分析,報告認為:25%的重大科學發現并不符合“提出假設—設計實驗—驗證假設”的傳統科學范式;推動這些發現的一個共同要素是復雜科學方法與工具的使用——數學與統計方法、多維建模,粒子加速器、X射線……
這些延伸了人類認知邊界的工具,才是科學突破的獨有引擎。而我們傳統認為的“假設—實驗—驗證”范式,不過是一種基礎普適思維底座。
21世紀的生命科學,以NBIC為主旋律的科技體系已經取得巨大進展,但我們尚需要一套新的認知框架來整合所取得的龐大的碎片化知識,然后再重新出發。
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讀書會簡介
免疫復雜性讀書會,是一個以免疫現象為核心場景,以復雜科學為方法論,試圖整合機制研究、數理建模、研發和臨床實踐問題來思考21世紀生命科學認知范式轉型的跨學科研討社群。
講者們來自各自領域的一線前沿,將基于自己長期的工作積淀與思考展開演講,同時提供精要的參考文獻。
本讀書會將圍繞一個臨床問題——如何優化以免疫治療為中心的控瘤策略?——來展開討論。
試圖以范式思考與理論建模視角,回歸到第一性原理的起點,去重構認知框架,激發對話與洞見。
發起人團隊認為,將免疫系統視為動態復雜適應性網絡,基于認知范式思考腫瘤免疫治療的瓶頸——或能對當前免疫治療的困境有所突破,構建出一套有效的聯合治療原則性框架,為臨床實踐提供指引。
讀書會主題:范式、理論與工具
——從假說驅動到復雜技術體系,從分子還原到系統涌現。
- 復雜科學范式:學科壁壘的破除
科學本質上是一個內在統一的整體。它被劃分為不同學科并非事物本質使然,而是源于人類認知能力的局限性,這種局限必然導致分工。實際上,從物理學到化學,從生物學和人類學直到社會學,存在著一條 不可分割的連續鏈條——任何環節都不應被武斷割裂。
——Max Karl Ernst Ludwig Planck
按照美國科學家Warren Weaver在1948年的分類,生命現象屬于有序復雜現象,需要跨學科的方法論。
隨著系統生物學的興起,目前已經實現對最小人造細胞JCVI-syn3A的4D高精度動力學建模,這個最新報道的虛擬細胞雖然不是完全基于第一性原理,而是綜合使用海量數據以參數擬合的方法實現的,但已經展示出壯麗的產業前景,如虛擬臨床試驗和藥物設計等。
免疫學在過去一個世紀的發展,在方法論上深受分子生物學的還原論范式主導。這一范式的成功是毋庸置疑的:從Jerne的免疫網絡理論(1974),到Sakaguchi發現CD4+CD25+ Treg細胞(1995);從Brunkow鑒定FOXP3基因(2001),到Chen和Mellman提出腫瘤免疫循環(2013)——正是基于分子生物學技術通過對個別分子或細胞的精細解析實現的。
當我們積累了足夠多的分子細節之后,一種迷惑展現出來:
我們知道得越多,似乎離“理解”越遠。
當還原論推進認知受到局限,范式轉移便成為歷史的召喚。美國科學院在2009年發布的《新生物學》白皮書,正是對此的回應。
該白皮書主張:生命科學正在從“分析單個組分”的時代,進入“理解組成部分如何協同互作以產生復雜系統行為”的時代。這不僅需要生物學內部的整合,更需要物理學、數學、工程學和計算科學的深度介入。
這一范式轉移當前已在系統免疫學、定量建模與跨尺度耦合等領域初步展現。
- 理論的價值:“新生物學”理論框架
一切科學的偉大目標,是從盡可能少的假設或公理出發,通過邏輯演繹,概括盡可能多的經驗事實。
——Albert Einstein
Einstein的這句話揭示了科學理論的最高理想:用極簡的邏輯框架解釋極豐富的經驗現象。人類對免疫現象的認知模式,可以歸類為描述性、機制研究、形式化與統一框架探索四種。
在數學形式化方向上,Harlapur等(2024)的工作展示了布爾邏輯網絡和常微分方程(ODE)如何捕捉Th細胞分化的核心動力學特征。這些模型揭示,基因調控網絡的多穩態性(multistability)是由轉錄因子之間的相互拮抗和自激活反饋所編碼的系統級屬性。T-bet與GATA3的相互抑制可導致Th1/Th2的多穩態;RORγt與FOXP3的相互抑制產生Th17/Treg的多穩態。當自激活強度超過相互抑制時,兩種命運決定因子可共表達,形成具有功能意義的雜交狀態——這一預測已被實驗證實。
這類形式化理論的價值不僅可解釋已知現象,也具有預測能力:模型可以預測哪些參數擾動將導致狀態轉換,從而指導實驗設計和治療干預。
Tripathi等提出的Treg-Tconv-APC三細胞回路理論,試圖用同一框架解釋Treg在不同情境下的所有功能。在這個抽象模型中,穩態耐受、防御應答和炎癥消退這三個程序被看作是同一回路在不同參數配置下的動力學操作模式——這類似于動力系統中的分岔(bifurcation)現象。
當回路參數(如Treg頻率、IL-2親和力、APC共刺激水平等)正常時,系統運行于穩態耐受模式;當病原體抗原大量呈遞打破平衡時,系統切換至防御模式;當病原體清除后,系統通過參數反饋恢復至穩態。
這一理論強調了前饋與反饋的相對強度如何決定系統的整體行為——這展現了用極少的假設(三個細胞類型之間的相互作用拓撲)來解釋大量經驗事實(Treg的多功能性)的科學思想。
- 技術與工具的本質,技術和認知的交互
技術,是被捕獲并加以利用的現象的集合,是對現象有目的的編程。而我們所使用的每一個工具、每一臺裝置,都是這種編程在現實中的一次遞歸組合與封裝——它們既是已有技術的產物,又是構建未來技術的模塊。技術正是通過這樣無限遞歸的組合,從自身中創生自身,并像生命一樣不斷進化。
——William Brian Arthur
Arthur的這段話揭示了一個深刻的技術哲學:技術是一個自我進化的生態系統。回顧免疫現象研究中的技術演進,我們恰好可以看到Arthur所說的“遞歸組合與封裝”。
在“前單細胞時代”,研究者傾向于將Treg視為一個相對均一的群體,核心問題是“哪個分子負責Treg抑制”。
Treg不是靠單一分子運作的“剎車片”,而是類似能夠在不同炎癥場景中調用不同工具箱的調控系統。這種從“清單式機制羅列”到“原則式生物學解釋”的轉變,很大程度上得益于單細胞技術所揭示的Treg高度異質性。
同樣,CD4+ T細胞分化的經典范式——Th1/Th2的二分格局——統治了近二十年,直至Th17細胞的發現才被打破。而今,得益于單細胞技術和計算建模,我們知道Th1/Th2/Th17/Treg之間的邊界并非固定——雜交表型的存在、表觀遺傳的雙價修飾(H3K4me3與H3K27me3共存)維持的“ poised ”狀態、以及細胞因子環境驅動的可塑性轉化,都指向一個比經典范式所描述的更為動態和靈活的景觀。
在免疫檢查點領域,技術進步同樣推動了認知更新。PD-1和CTLA-4抑制劑的突破性成功催生了大量針對“第二代免疫檢查點”(LAG-3、TIM-3、TIGIT等)的藥物開發努力。但Tang和Veillette冷靜地指出,這些努力大多未能重現PD-1/CTLA-4的成功。
原因在于,免疫系統中的檢查點調控遠非簡單的“阻斷即激活”開關模型,而是涉及多細胞類型、多信號通路和多層次代償的復雜網絡。
這一認知的修正,正是新一代高通量技術——特別是單細胞多組學和空間轉錄組學——所推動的。
在代謝領域,傳統觀點認為T細胞活化遵循從氧化磷酸化到有氧糖酵解的經典代謝轉換范式。但Longo等利用穩定同位素示蹤等先進技術揭示,這一模型過于簡化:活化的T細胞實際上同時運行糖酵解和氧化磷酸化程序,將不同營養物質戰略性分配至特定途徑。生理條件下,CD8+效應T細胞優先將葡萄糖分配用于磷酸戊糖途徑和核苷酸合成等合成代謝分支,而非大量轉化為乳酸——這一發現完全依賴于先進代謝示蹤技術,并改變了我們對T細胞代謝編程的理解。
- 臨床實踐:治療響應預測與聯合調控
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1891年人類的第一個治療性抗體用于治療致死性傳染病白喉,其中一個個案中取得顯著效果。隨后的1894年,經系統化科學觀察其臨床療效得到科學驗證,該治療性抗體的出現使得白喉的臨床結局因之發生了突破性的改善。
1984年,距離Watsen與Crick這對好基友基于X衍射成像與第一性原理在建模的基礎上推測出量子英雄們苦思不得解的DNA結構已經過去了31年。該年,法國科學家基于分子生物學技術,發現了細胞膜上一種在自然界存在了數億年的蛋白質分子CTLA-4。
1995年,11年后,美國科學家James Allison通過實驗證明,阻斷CTLA-4可以增強T細胞抗腫瘤活性,并導致小鼠腫瘤消退。
如今距離第一個免疫檢查點抑制劑上市已經15年,以免疫為中心的聯合治療成為癌癥控制策略的主旋律。
本讀書會將最終聚焦在一個臨床現實問題:宿主免疫響應的評估與全程管理,聯合治療策略的原理、機制框架與策略證據;基于第一性原理的癌癥生存者系統治療與局部管控策略框架。
讀書會框架
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發起人
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秦健勇:腫瘤專科醫生
長期從事臨床腫瘤學工作,中國抗癌協會腫瘤內分泌及運動康復專委會委員,食管腫瘤整合康復專委會常委。對腫瘤代謝與免疫、癌癥生存者問題有深入探索,長期關注復雜科學框架對復雜生命現象的工具價值,嘗試以新生物學理念理解復雜生命現象。
聯合發起人
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敖平:理論物理學博士,系統生物學的早期開拓者,演化力學理論的建構者。
四川大學生物醫學工程學院教授,博士生導師。本科畢業于北京大學,獲學士學位,隨后由李政道先生的cuspea學者項目赴美國伊利諾大學香檳分校攻讀博士學位,并曾在華盛頓大學物理系從事博士后研究。
敖平教授的研究集中于系統生物學中的計算方法和基礎理論框架的建立,主要包括λ噬菌體遺傳開關的穩定性,以及生物網絡中可靠性和穩定性的隨機統計方法;利用隨機動力學方程組的特解方法的優勢,將Darwin-Wallace演化動力學融入了具備一致性和簡明性特點的數學框架中。
在復雜疾病機理上與系統生物倡導人Leroy Hood等提出癌癥發生、發展的新理論:癌癥的內源性網絡理論;并發展相應數學和計算工具:隨機過程中的勢函數。
目前敖平教授的博士論文總引用超過1000次,已發表了近145篇研究論文,其中3篇發表于國際頂級期刊美國科學院院刊(PNAS),16篇發表于物理學領域頂級期刊物理評論快報(PRL),超過45篇為生物學相關領域的論文。
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雷錦志:一般力學博士,數學生物學研究者。
天津工業大學數學科學學院教授,博士生導師,主要從事應用數學、生物數學和計算系統生物學等研究,在癌癥演變動力學、干細胞增殖的多尺度建模等領域取得一系列研究成果,提出原創的異質性干細胞增殖過程數學模型框架。主要研究方向為應用數學、計算系統生物學、生物數學。
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張曉實:臨床醫生,腫瘤免疫治療深度思考者。
中山大學附屬腫瘤醫院生物治療研究中心副主任兼病區區長,教授、主任醫師,博士生導師、黑色素瘤首席專家。
1983年畢業于重慶醫科大學大學醫療系,1998年重慶醫科大學醫學博士畢業。張曉實教授是我國腫瘤免疫治療的早期探索者,擅長黑色素瘤的綜合治療及肝癌、腸癌、肺癌、乳腺癌等實體腫瘤的免疫治療。
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秦曉玉:生物工程專業博士生,生命科學研究范式思考者。
中國科技大學生命科學院博士生。本科期間加入視覺系統課題組完成科研啟蒙。在美國跨學科生物工程實驗室留學期間,從事生命科學多Hierarchy研究。頗受SFI復雜科學思維框架啟發,引發對生命科學研究范式的探索。
特邀嘉賓
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呂有勇:腫瘤生物學科研工作者,生命科學范式反思者。
北京大學腫瘤醫院二級教授,北京市腫瘤防治研究所資深研究員。
國家杰出青年基金獲得者;北京大學(醫學部)優秀人才獎勵計劃教授,美國中華醫學會杰出教授獎獲得者(1994),全國百名青年醫學科技新星稱號(1993),國務院特殊津貼專家(1992)。
主要從事腫瘤基因組、蛋白質組、腫瘤生物學和分子診斷與細胞基因治療研究,積極推動胃腸腫瘤分子分型與個體化治療的轉化研究;承擔國家杰出青年基金、國家973和863重大項目等課題。重點推動我國重大疾病分子分型和個體化診療及腫瘤基因組研究。
在開展研究工作的同時注重技術平臺和跨學科研究體系與范式的建立、積極開展國內外學術交流和科研合作,并致力與促進臨床與基礎一體化研究模式的建立和科研成果的轉化與應用推廣。
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王小川:百川智能創始人兼 CEO,清華計算機工程博士。
對生命復雜性充滿好奇心,試圖以數學為工具建構生命大模型。
高中時用吳文俊消元法在微型機完成初等幾何命題證明,1996 年獲國際信息學奧賽金牌。曾任搜狗 CEO,主導開發搜狗輸入法、瀏覽器、搜索等產品,獲多項國家級科技獎項與榮譽。
2023 年創立百川智能,聚焦醫療 AI,以 “為生命建模型,為人類造醫生” 為使命。作為國內專注醫療領域的大模型企業,其成果顯著:2024 年 10 月,百川醫療大模型在中美執業醫師考試準確率超越 OpenAI;2025 年 2 月,全球首個 AI 兒科醫生在北京兒童醫院投入使用并獲專家認可。
特邀主持人
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張雅文:集智俱樂部上海站聯合發起人。
作為AI產品經理與AI創新戰略專家,她同時也是博雅與復雜科學愛好者,以及 AI for Good 的踐行者。她曾主導發布中國首本《科技包容 數字普惠》白皮書,長期致力于用商業與技術賦能具有中國當代特色的社會創新。面對智力資源無限的AI時代,她堅信個體已被賦予獨立完成「科研-產業-博雅」全鏈路閉環的超級能力。她正致力于推動個體賦能,促進創新者之間的連接與深度溝通,以期涌現出群體智能。她主張將這種技術驅動的涌現力量,切實轉化為推動良好健康與福祉(SDG 3)、優質教育(SDG 4)及產業創新(SDG 9)的落地價值。
運營助理
曹雨:廊坊師范學院電子信息工程學院軟件工程專業本科生。
適合誰參加?
本次讀書會以免疫現象為具體場景,聚焦腫瘤免疫學實踐中的核心困惑這一真實臨床問題,嘗試以多學科和第一性原理的方式來一次持續約半年的討論,試圖回歸到本體論的源頭探討當前腫瘤免疫治療臨床中核心挑戰的邊界和優化框架。
本次讀書會薈萃了領域內前沿一線的專家學者,每次線上會討論時間長達1小時左右;非常適合同樣也在困惑中思考的你,加入社區在線交流,分享、爭鳴、聚合或思維接力,互相激發出前所未有的思想火花。
本讀書會面向:
· 生命科學、醫學相關的本科生、研究生及科研工作者,希望從范式層面深化對本領域的理解
· 物理、數學、計算機等理工背景的研究者,對生命系統的復雜性充滿好奇
· 臨床醫生與醫療從業者,希望從系統科學視角重新理解疾病與治療
· 對生命復雜性感興趣的知識分子,渴望在科學與哲學的交匯處獲得思想啟發
· 集智俱樂部復雜科學社群成員,希望將復雜科學工具拓展至生命與醫學領域
信息論的開山宗師Claude Shannon1952年在貝爾實驗室做過一個內部演講《Creative Thinking》,其中提到一條是“以盡可能多的不同形式復述問題”。
他認為“換個詞來描述問題。改變已有的觀點。從每一個可能的角度來看問題。做完之后,你可以嘗試同時從多個角度來看,或許你可以洞察問題的真正基本問題,從而將重要因素關聯起來,得出結論。做到這一點真的很難,但做到這一點很重要。如果你不這樣做,很容易陷入思維定式。”
其實每個人都有自己的看問題視角,也有自己的思維定式,不自覺地就把自己裝進了籠子里。旁觀者清,在討論與交流中,你可以超越肉體的囚籠,在他人身上看到一個另外的自己。這可能就是討論的意義所在。
誠摯邀請求知若渴的你帶著開放輕松的態度,讓我們一起開啟一場直擊靈魂的激情之旅吧。
本讀書會的思想邏輯
工具延伸認知 → 認知重塑范式 → 范式生產洞見 → 洞見突破邊界
面對生命這樣高維度的復雜系統,積累更多數據本身并不構成理解。新工具帶來新的可見度,但把可見的東西組織成可解釋的知識,卻是一項藝術,標刻著認知的新境界。
實驗室與臨床的隔離、學科與學科之間的壁壘,是知識生產效率低下的根本原因。新生物學2009呼吁打破這些壁壘,在“ 從基礎科學到應用” 的全鏈條上實現知識的自由流動與協同創新。
美國科學院新生物學2009宣稱:
新生物學家不是懂一點兒所有學科的人,而是在某一學科擁有深厚積累、同時對多個領域具備基本流利度的人。
通過本次讀書會,如果希望達到以下三個方面有所啟發,刷新您對生命科學認知范式圖景的理解:
范式層面,從Planck的科學統一愿景出發,基于免疫學正在經歷從分子還原到系統綜合的事實,打破學科邊界,構建起以問題為驅動的資源整合信仰。
理論層面,以Einstein的公理化理想為標尺,審視當前免疫學理論的成熟度,基于已有的描述性框架和形式化模型探索,探尋具有普遍解釋力的理論框架,重現Niels Jerne1974的榮光。
工具層面,參考Arthur的技術進化哲學,追蹤免疫學技術棧的遞歸演化,重塑我們的認知框架,在科學發現的道路上構建服務于自己科研體系的技術與工具系統。
讀書會在做什么
免疫復雜性讀書會,從2026年4月13日開始,每周一晚19:30,連續半年,聚焦免疫復雜性主題。
讀書會主題劃分為三個模塊:
【導言】生命科學范式漫談
由資深生命科學研究者朱景德教授激情暢談復雜系統范式對于生命科學研究的意義。
【機制解讀篇】
由中國學者敖平教授介紹基于普適的達爾文演化力學這個第一性原理發展起來內源性網絡理論在理解復雜生命現象中的應用;這部分的整體架構是以EVO-DEV-ECO框架展開的,邀請國內研究免疫機制演化和發育的頂尖團隊,分享他們的研究成果。同時對免疫機制的核心問題如免疫代謝、T細胞功能調控網絡、神經-免疫的對話由長期關注此問題的資深學者展開探討。
范式轉換需以方法論為基礎,由在此領域深耕的青年才俊介紹干濕結合的生物學機制研究方法,免疫穩態與免疫韌性是免疫健康的主旋律,我們也嘗試基于復雜科學視角嘗試對其進行解讀……
【數理建模篇】
數學本質上是一種精確和強邏輯的描述性語言工具,通用的數學符號體系建立起來后數學作為工具為人類深化對自然界的認知起了不可或缺的驅動作用,數學在不斷演化中發展,不斷拓展著人類的認知邊疆。
不少大物理學家都曾感嘆數學不可思議的有效性,數學,尤其是對稱性思想在構建物理學宏偉大廈的過程中是不可缺少的工具。數學在科學發展史上的巨大作用,使得科學家們又嘗試以數學工具介入對生命現象的探索,但又難免惆悵:喟嘆其不可思議的無效性。
癌生物學家 Robert Weinberg 提出“數學能否幫助人們理解生物系統復雜行為的合理性”這樣一個極具挑戰的問題。應用數學家林家翹先生提出“20世紀的應用數學聚焦于物理學問題,21世紀的應用數學數學應致力解決生命學問題”,預示了數學與生命科學交叉融合的重要性。在數理建模篇,將由國內一流的數學生物學團隊介紹他們在這一領域的探索,側重于腫瘤免疫相互作用的數學建模,嘗試通過機理與數據驅動相結合的研究手段,采用微分方程組(隨機或確定性)并結合隨機模擬來描述腫瘤免疫響應的動力學演變過程。
虛擬細胞在當前AI高歌猛進的時代背景下似乎成了時代的寵兒——2026年伊始,最小人造細胞JCVI-syn3A的數字克隆取得新的進展——虛擬細胞精確復現了細胞分裂動力學周期和關鍵事件。虛擬細胞是理解生命現象的前沿領域,被寄希望應用于藥物研發和臨床藥理學領域。本次讀書會邀請到了首屆全球虛擬細胞大賽冠軍團隊百圖生科技術副總監郭玉成博士,他將對該次突破性虛擬細胞建模的技術路線進行解讀,郭玉成博士目前已經著手在實驗室復現此次虛擬細胞的動力學過程。
【工程技術篇】
這一模塊將從國藥之光康方生物雙抗類藥物的研發實踐開始,討論免疫調節工具研發的工程實踐,藥物的臨床驗證和優化使用情況。最后聚焦到臨床痛點,宿主治療響應的評估與監測,提高藥物有效率的聯合治療和系統管理策略。
模塊的設計初衷是希望通過系統回顧雙特異性抗體的研發邏輯、PD-1抑制劑的臨床藥理、免疫紊亂的抗炎治療、情緒應激與免疫應答之間的機制,結合幾個具體的典型案例,來討論:
宿主免疫對治療響應的監控與控制
如何優化腫瘤免疫聯合治療方案?
進而在本模塊跨學科討論的基礎上回歸到第一性原理,探討新生物視角下臨床困境的出路和科學探索方向。
【總結】由在腫瘤免疫學領域深耕20余年的張曉實教授主持討論,主題是“提高腫瘤免疫治療應答率的聯合用藥策略和系統管理框架”。
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運行模式
「免疫復雜性」讀書會2026季正式啟動
時間規劃:2026年4月13日開營,共持續26周左右。
參與形式:騰訊會議——每周一晚上 19:30-21:30。
報名您將獲得:
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我們鼓勵圍繞系統腫瘤免疫學、系統生物學、復雜網絡與數學生物學及相關具體問題的深入探討。為保證討論質量,請避免發表脫離本期讀書會主題、缺乏實證基礎或過于空泛的哲學思辨類內容。
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一點期待
以免疫檢查點抑制劑為代表的突破性腫瘤免疫治療已經走過了15年的歷史,檢查點抑制劑在很多癌種里確實改變了預后。
但在多數實體瘤中,客觀緩解率還停留在20%上下。我們如今對免疫網路系統的啟動與調節機制仍然理解甚少,未來仍需要望遠鏡和顯微鏡并用,才能一點點迭代我們的認知,優化我們的調控工具。
一部文明史,就是一部人類認知的迭代史。相信SFI關于生命第一性原理的探索和新生物2009這樣的整合性框架必定會給我們前進的道路上帶來一些有益的啟示和助力。
推薦閱讀文獻
· Hermann Kossel(1894):Ueber die Behandlung der Diphtherie des Menschen mit Diphtherieheilserum
. Niels Jerne(1974):Towards a network theory of the immune system
· Alan Perelson(1989):Immune Network Theory
· 敖平(2005):Laws in Darwinian evolutionary theory
· Geoffrey Hoffmann(2008):Immune Network Theory
· Klaus Eichmann(2008):The Network Collective:Rise and Fall of a Scientific Paradigm
· 左漢賓(2008):從抗體到復合免疫網絡:免疫學理論進化及其方法論研究
· 美國國家科學院(2009):A New Biology for the 21st Century: Ensuring the United States Leads the Coming Biology Revolution
· Robert Weinberg(2010):Tumor-Host Interactions: A Far-Reaching Relationship
· Daniel Chen & Ira Mellman(2013):Oncology meets immunology: the cancer-immunity cycle
· Athena Aktipis(2015):Cancer across the tree of life: cooperation and cheating in multicellularity
· James Allison(2015):Immune Checkpoint Targeting in Cancer Therapy: Toward Combination Strategies with Curative Potential
· 曹雪濤(2016):Characteristics and Significance of the Pre-metastatic Niche
· 吳克復(2016):免疫的細胞社會生態學原理
· Daniel Chen & Ira Mellman(2017):Elements of cancer immunity and the cancer-immune set point
· Beata Ujvar et al.(2017):Ecology and Evolution of Cancer
· Galluzzi L et al.(2018):The hallmarks of successful anticancer immunotherapy
· 陳列平(2018):A Paradigm Shift in Cancer Immunotherapy: From Enhancement to Normalization
· Bernhard Strauss et al.(2021):Rethinking Cancer: A New Paradigm for the Postgenomics Era
· Guido Kroemer(2023):Bodywide ecological interventions on cancer
· 吳家睿(2024):新科學時代的思考
· 王峰(2024):Combined anti-PD-1, HDAC inhibitor and anti-VEGF for MSS/pMMR colorectal cancer: a randomized phase 2 trial.
· Alexander Krauss(2024):Redefining the scientific method: As the use of sophisticated scientific methods that extend our mind
· 雷錦志(2025):Mathematical Modeling of Tumor-Immune Interactions: Methods, Applications, and Future Perspectives, CSIAM Trans. Life Sci. 1(2): 200-257. doi:10.4208/csiam-ls.SO-2024-0008.
· Charles Swanton(2024):Embracing cancer complexity: Hallmarks of systemic disease
· Maya Arce(2024):Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation
· 周彩存(2025):Ivonescimab versus pembrolizumab for PD-L1-positive non-small cell lung cancer (HARMONi-2): a randomised, double-blind, phase 3 study in China
· Douglas Hanahan(2026):Hallmarks of cancer—Then and now, and beyond
閱讀材料選取說明
從1894年第一個治療性抗體的臨床觀察發表,一直到2026年Hanahan對癌癥現象的最新綜述,這中間跨越了132年。
期間,生命科技迅猛發展,經歷了DNA結構的解析、物理學家Delbruck將定量研究方法引入生命科學研究、分子生物學的興起、單克隆抗體技術和DNA測序技術的大規模應用、CRISPR技術、最小人造細胞的探索、虛擬細胞技術的發展,以及AI技術的爆火。
在長達132年的時間里,選取的這些文獻企圖以蜻蜓點水的手法,對這百年來壯麗的認知迭代史致敬。時間起點為1894年,這是一個中國人難以忘卻的時間節點,也是中國人大規模覺醒的時間節點,但更是人類第一個治療性抗體有效性得到科學認證的時間節點。對我而言,這次讀書會也有另外一層意思,某種意義上是為了紀念2018年初的一個讀書總結(),這篇讀書體會出來后正值免疫治療獲得諾獎的那一年,無意中蹭了一個熱點。
如今這個線上讀書會,也算是對2018年的這個8年前讀書經歷的一種紀念吧。
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