近日,東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗科主任吳國球教授團隊圍繞阿爾茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)早期篩查與數(shù)字化分型管理需求,在國際權(quán)威數(shù)字醫(yī)學(xué)期刊《npj Digital Medicine》(中科院一區(qū)Top期刊)發(fā)表題為“A Machine Learning–Enabled Blood Transcriptomic Signature for Digital Diagnosis and Subtyping of Alzheimer’s Disease”的研究成果。該研究聚焦“血液樣本實現(xiàn)AD早期識別與分型”的臨床痛點,為AD的無創(chuàng)篩查與數(shù)字化分層管理提供了新的解決方案。東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士研究生馬碩、碩士研究生陳達文為共同第一作者,吳國球教授為通訊作者。
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據(jù)介紹,AD早期識別對延緩疾病進展與優(yōu)化診療路徑至關(guān)重要,但傳統(tǒng)檢測在大規(guī)模篩查場景中常受侵入性、高成本與設(shè)備普及性限制。為此,吳國球教授團隊以“乳酸化(lactylation)相關(guān)分子網(wǎng)絡(luò)”為機制切入點,整合多隊列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并建立標(biāo)準(zhǔn)化機器學(xué)習(xí)建模流程(z-score標(biāo)準(zhǔn)化、隨機森林篩選、plsRglm建模及10折交叉驗證),構(gòu)建了可解釋的血液轉(zhuǎn)錄組風(fēng)險評分—乳酸化衍生評分(Lactylation-Derived Score,LDS),并在外部腦轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集及獨立臨床血漿隊列(n=540)中完成驗證。其創(chuàng)新在于以機制驅(qū)動提煉出便于臨床轉(zhuǎn)化的小面板(7基因:GFAP、GTF2I、RB1、PFKM、BCLAF1、SPR、SMARCC1),并與血漿p-tau181/217進行互補融合以提升實用性。研究結(jié)果顯示,LDS在訓(xùn)練隊列區(qū)分AD與正常對照(NC)的AUC為0.897,在獨立臨床血漿隊列中AUC為0.772;聯(lián)合LDS+p-tau181+p-tau217后,三指標(biāo)模型在獨立臨床血漿隊列中的AUC提升至0.859;同時LDS對AT?個體具有分層識別能力(AUC 0.861),并為前驅(qū)期人群分層提供線索(基于LDS基因衍生的五基因分類器對aMCI的AUC為0.809)。
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LDS在AD中的開發(fā)與轉(zhuǎn)化應(yīng)用總體工作流程
該研究為“血液樣本即可實現(xiàn)AD數(shù)字化診斷與分型”提供了系統(tǒng)證據(jù):一方面有望支持記憶門診分診、體檢/社區(qū)篩查與隨訪監(jiān)測中的風(fēng)險評估與分層管理,提升早期識別的可及性;另一方面,通過與成熟血漿蛋白標(biāo)志物的聯(lián)合策略,可在更貼近真實臨床流程的條件下獲得更穩(wěn)健的判別能力,為推進AD早篩與精準(zhǔn)干預(yù)提供新的工具與思路。(通訊員趙峰峰 編輯崔玉艷 校對蔡逸秋編審程守勤)
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