撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
你是否曾好奇,采摘后放在冰箱里的草莓,它們的生長(zhǎng)已經(jīng)停止,但內(nèi)部的生命活動(dòng)是否完全靜止?
一項(xiàng)發(fā)表于Cell期刊的最新研究揭示了一個(gè)令人驚訝的發(fā)現(xiàn)——在低溫冷藏(4°C)條件下,采摘后的草莓果實(shí)中的經(jīng)典“生物鐘”被破壞,但有一個(gè)全新的非經(jīng)典“生物鐘”仍在默默工作,它不僅維持著晝夜節(jié)律,還充當(dāng)著抵抗灰霉病(導(dǎo)致植物腐爛的真菌感染)的“守門人”。
該研究以:Discovery and heterologous reconstitution of a plant noncanonical quasi-circadian gene regulatory network 為題,于 2026 年 5 月 12 日,發(fā)表在國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊Cell上,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、基因功能研究與操控全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、生命科學(xué)聯(lián)合中心王偉研究員為論文通訊作者,王姝瑜博士為論文第一作者。
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該研究的核心發(fā)現(xiàn):
在低溫條件下,許多植物的典型“生物鐘”會(huì)受損;
草莓中一種新的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)能夠產(chǎn)生晝夜節(jié)律;
在煙草中異源重建草莓的晝夜節(jié)律基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò);
草莓中的非典型晝夜節(jié)律基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)控制并促進(jìn)對(duì)灰霉病的防御。
經(jīng)典“生物鐘”在低溫下“失靈”
大多數(shù)生物,包括植物,都擁有一個(gè)內(nèi)在的晝夜節(jié)律系統(tǒng),即所謂的“生物鐘”。它像一位精準(zhǔn)的指揮家,協(xié)調(diào)著各種生理過程,使其與地球自轉(zhuǎn)所帶來的晝夜變化同步。在植物中,這個(gè)核心生物鐘由一系列轉(zhuǎn)錄因子構(gòu)成的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)驅(qū)動(dòng),例如擬南芥中的 CCA1、LHY 和 TOC1 等。
然而,當(dāng)環(huán)境溫度降低時(shí),這個(gè)精密的生物鐘系統(tǒng)往往會(huì)出問題。研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),將采摘后的草莓果實(shí)置于4°C的低溫連續(xù)光照條件下儲(chǔ)存時(shí),其經(jīng)典生物鐘核心組件(例如 FvLHY 和 FvTOC1)的表達(dá)節(jié)律完全消失,變得雜亂無章。采摘后即使在 20°C 的常溫下,除了 FvTOC1 外,其他大多數(shù)經(jīng)典生物鐘基因也失去了節(jié)律。這意味著,在草莓果實(shí)采摘后,無論是冷藏還是常溫存放,其經(jīng)典生物鐘機(jī)制基本上都“停擺”了。
發(fā)現(xiàn)一個(gè)神秘的“替補(bǔ)”生物鐘
既然經(jīng)典生物鐘不工作了,那么草莓果實(shí)內(nèi)部的新陳代謝是否就陷入一片混沌呢?
令人意外的是,通過 RNA 測(cè)序分析,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在低溫儲(chǔ)存的草莓中,依然有 275 個(gè)基因保持著清晰的晝夜表達(dá)節(jié)律。這些基因主要與蛋白質(zhì)的合成、折疊和儲(chǔ)存相關(guān)。
更關(guān)鍵的是,在這批有節(jié)律的基因中,他們找到了 9 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。通過雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)和基因網(wǎng)絡(luò)分析,研究團(tuán)隊(duì)最終鎖定了一個(gè)由 5 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子(FvGRAS、FvMYB109、FvVOZ、FvERF4 和 FvERF105)構(gòu)成的核心調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。這個(gè)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)富含負(fù)反饋調(diào)節(jié),這與經(jīng)典生物鐘網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)特征相似,但它所使用的“組件”(轉(zhuǎn)錄因子)卻完全不同。研究團(tuán)隊(duì)將其命名為“非經(jīng)典準(zhǔn)晝夜節(jié)律基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)”(noncanonical quasi-circadian gene regulatory network)。
這個(gè)新發(fā)現(xiàn)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)具備生物鐘的關(guān)鍵特征:它的自由運(yùn)行周期接近 24 小時(shí);具有溫度補(bǔ)償能力(即在不同的溫度下周期保持相對(duì)穩(wěn)定);能夠被溫度循環(huán)等外界信號(hào)重新設(shè)定和同步。不過,它的節(jié)律持續(xù)性不如經(jīng)典生物鐘長(zhǎng)久,在長(zhǎng)時(shí)間的自由運(yùn)行條件下會(huì)逐漸衰減,因此被定義為“準(zhǔn)”晝夜節(jié)律(quasi-circadian)。
在煙草中“重建”草莓的生物鐘
為了證明這個(gè)新發(fā)現(xiàn)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)本身確實(shí)具有產(chǎn)生晝夜節(jié)律的能力,而非依賴于草莓的其他背景,研究團(tuán)隊(duì)完成了一項(xiàng)開創(chuàng)性的工作——在異源植物煙草中,成功重建了這個(gè)完整的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一個(gè)精巧的三模塊系統(tǒng):一個(gè)“驅(qū)動(dòng)模塊”提供初始表達(dá)動(dòng)力;一個(gè)“基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模塊”包含五個(gè)轉(zhuǎn)錄因子及其自身啟動(dòng)子;一個(gè)“報(bào)告模塊”用來監(jiān)測(cè)晝夜節(jié)律輸出。當(dāng)且僅當(dāng)所有五個(gè)轉(zhuǎn)錄因子都被共同表達(dá)時(shí),報(bào)告基因才展現(xiàn)出穩(wěn)健的晝夜節(jié)律振蕩,從而強(qiáng)有力地證明了該基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)自身就是一臺(tái)獨(dú)立的“晝夜節(jié)律發(fā)生器”。
不僅是“生物鐘”,更是免疫“指揮官”
那么這個(gè)在低溫下依然工作的“生物鐘”有什么實(shí)際作用呢?研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),它并不是一個(gè)可有可無的備選生物鐘。當(dāng)研究團(tuán)隊(duì)在草莓果實(shí)中進(jìn)行特異性干擾這一“生物鐘”時(shí),草莓果實(shí)對(duì)灰霉菌(Botrytis cinerea,導(dǎo)致水果腐爛的常見病原菌)的易感性顯著增強(qiáng)。
這表明,該“生物鐘”能夠“門控”并促進(jìn)草莓的防御反應(yīng)。在低溫儲(chǔ)存這種壓力條件下,經(jīng)典生物鐘失效,而這個(gè)替補(bǔ)上場(chǎng)的非經(jīng)典“生物鐘”接管了部分指揮權(quán),協(xié)調(diào)下游防御相關(guān)基因的節(jié)律性表達(dá),從而幫助果實(shí)更有效地抵抗病原菌侵襲,延長(zhǎng)保鮮期。
總結(jié)與展望
這項(xiàng)研究打破了我們對(duì)植物生物鐘的固有認(rèn)知:
1、發(fā)現(xiàn)了新機(jī)制:揭示了在經(jīng)典生物鐘失效的條件下,植物可以利用一套完全不同的基因組件構(gòu)建出具備核心生物鐘特性的替代基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
2、實(shí)現(xiàn)了技術(shù)突破:首次在真核生物中實(shí)現(xiàn)了復(fù)雜晝夜節(jié)律基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的異源重建,為研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)力學(xué)提供了強(qiáng)大工具。
3、揭示了新功能:闡明了這種非經(jīng)典“生物鐘”在采摘后的果實(shí)免疫防御中的關(guān)鍵作用,連接了生物鐘與植物免疫兩個(gè)重要領(lǐng)域。
這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)不僅深化了我們對(duì)生命節(jié)律起源與多樣性的理解,也為農(nóng)產(chǎn)品采摘后保鮮技術(shù)的開發(fā)提供了全新思路。未來,或許我們可以通過調(diào)控這個(gè)非經(jīng)典“生物鐘”來增強(qiáng)水果的抗病性,減少冷藏保存和運(yùn)輸過程中的損耗,讓更新鮮的水果蔬菜走上餐桌。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.04.033
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